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我国地方鸡种保种群微卫星多态性分析与分子标记档案建立

利用经过筛选的20个微卫星标记对国家家禽品种资源基因库中保存的11个地方鸡种保种群进行了遗传检测,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离,并用类平均法进行聚类分析.研究结果表明:1、20个微卫星标记在11个地方鸡种保种群共检测到176个等位基因,基因频率分布在0.01 3~0.838之间,每个微卫星座位的等位基因数在6~11个之间,平均为8.8个.检测到等位基因中,有45个等位基因为11个地方鸡品种所共有,其中MCW145检测到的6个等位基因在11个地方鸡种中都出现.2、11个地方鸡品种20个微卫星标记的平均杂合度在0.6... 利用经过筛选的20个微卫星标记对国家家禽品种资源基因库中保存的11个地方鸡种保种群进行了遗传检测,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离,并用类平均法进行聚类分析.研究结果表明:1、20个微卫星标记在11个地方鸡种保种群共检测到176个等位基因,基因频率分布在0.01 3~0.838之间,每个微卫星座位的等位基因数在6~11个之间,平均为8.8个.检测到等位基因中,有45个等位基因为11个地方鸡品种所共有,其中MCW145检测到的6个等位基因在11个地方鸡种中都出现.2、11个地方鸡品种20个微卫星标记的平均杂合度在0.6800~0.7432之间.其中藏鸡最高,为0.7432;狼山鸡最低,为0.6800.群体杂合度的研究结果与基因库中各鸡种保存的现实状况基本相吻合.3、11地方鸡种保种群20个微卫星座位的平均多态信息含量在0.6329~0.7023之间,均大于0.5,表现为高度多态性.这一结果反映基因库中保存的这些地方鸡种的群体遗传多样性丰富,从而也表明这些地方鸡种保种群实施的"家系等量随机选配法"的效果良好.4、11个鸡种聚为4类.丝羽乌骨鸡、茶花鸡、仙居鸡、藏鸡、萧山鸡聚为一类,鹿苑鸡、狼山鸡聚为一类,固始鸡、北京油鸡、大骨鸡聚为一类,河南斗鸡单独聚为一类.5、通过利用20个微卫星位点检测不同世代群体中等位基因及其频率、群体基因平均杂合度和多态信息含量,建立地方鸡种保种群微卫星标记档案,并分析世代间的差异,可以达到监测保种效果的目的.

目录概览

我国地方鸡种保种群微卫星多态性分析与分子标记档案建立 目次

封面

文摘

英文文摘

独创性声明及关于论文使用授权的说明

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第一章前言

1.1地方鸡种资源及保护研究状况

1.2微卫星标记的研究与应用

1.3本研究的目的和意义

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第二章试验材料和方法

2.1基因库中地方鸡种保存方法

2.2试验材料

2.3试验方法与统计分析

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第三章结果与分析

3.1基因组DNA的提取及其浓度及纯度检测

3.2微卫星DNA的PCR扩增结果及其多态性

3.3 11个地方鸡种保种群20个微卫星标记的等位基因与频率

3.4 11个地方鸡种保种群的基因杂合度和多态信息含量

3.5 11个地方鸡种保种群的平均基因杂合度和多态信息含量

3.6各品种间的遗传距离

3.7各鸡种间的聚类分析

+

第四章讨论

4.1微卫星DNA分析技术PCR条件探讨

4.2等位基因及频率分析

4.3各保种群体内遗传分析

4.4地方鸡种保种群间的遗传分析

4.5保种群分子标记档案的建立与用微卫星DNA分析技术监测保种效果的可行性探

第五章结论

参考文献

致谢

个人简历

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