基于支持向量机的蛋白质相互作用识别

支持向量机(SVM)是广泛应用于各个领域的分类算法,包括生物信息学.本研究应用SVM作为蛋白质相互作用的分类算法,所用蛋白质相互作用数据下载于墨尼黑生物信息学中心的酿酒酵母数据集,包含有6 736条蛋白质,其中相互作用的有4 837对,不相互作用的有9 674对.提取蛋白质主要结构的电荷和等电位点特征,并应用SVM分类算法对此进行了分类.结果显示,分类的正确率在60%左右,但是较系统发育谱法还是获得了较高的分类正确率.
用PCR的方法,从产甘油假丝酵母 WL2002-5中扩增出了产甘油关键酶 3-磷酸甘油脱氢酶(glycerol 3-phosphate dehydrogenase)和3-磷酸甘油磷酸酶(glycerol 3-phosphate phosphatase)的基因GPD和GPP.对这两个基因测序,发现基与酿酒酵母(Saccharomyces.cerevisiae)的GPD、GPP基因的相似性达99%.并构建了其在植物中的表达载体.
[目的]明确58份酿酒葡萄品种对葡萄霜霉病的抗性,为新疆酿酒葡萄品种的引种、栽培和抗病育种提供依据.[方法]采用室内离体叶片接种法,对58份酿酒葡萄品种的抗病性进行鉴定,依据接种第7d的病情指数和潜育期的长短,对其抗病性进行评价.[结果]58个酿酒葡萄品种分为四类,其中抗病性较强的品种16个,占27.59％;抗病性中等的品种22个,占37.93％;感病品种14个,占24.14％;易感品种6个,占10.34％.其抗病性与病害的潜育期存在一定的相关性,一般感病性越强,潜育期越短.[结论]供试58个酿酒葡萄品种均可被霜霉病菌侵染,其中抗病的有香槟、黑虎香、莱格纳、卡托巴等16个品种,中度抗病的有卡海特、黑后、黑贝蒂等22个品种,其它20个品种均为感病或高感品种.
以海洋球石藻(Emiliania huxleyi)病毒EhV-99B1基因组为模板,用一对病毒甾醇去饱和酶(sterol desaturase,SD)基因的特异性引物进行PCR扩增,获得EhV-SD基因,将扩增产物克隆至pMD19-T载体后进行测序,并对该基因编码的蛋白质序列进行生物信息学分析.将测序正确的目的基因亚克隆入酿酒酵母表达载体pYES2/CT中,转化酿酒酵母缺陷型菌株YMR015C,并用D-半乳糖诱导表达,提取重组酵母和野生型酵母细胞总脂并进行薄层色谱(thin layer chromatography,TLC)分析.结果显示:EhV-SD基因全长为987 bp,编码328个氨基酸,该蛋白质的理论等电点为8.31,预测的蛋白质分子质量为37.83 ku,为疏水性、 不稳定蛋白质,存在6个跨膜结构域,不存在信号肽;其二级结构中,α-螺旋含量最多.氨基酸序列比对结果显示,EhV-SD基因与宿主球石藻及金色藻属(Chrysochromulina sp.CCMP 291)亲缘关系较近.TLC结果表明,EhV-SD基因的表达导致酵母细胞极性较强的脂类明显减少,而极性较弱的脂质成分显著增加,表明EhV-SD具有一定的催化活性.
本申请公开了一种保健型白酒，属于白酒领域，用于保健，其包括酒精度为55~60°的白酒80~90份、皂苷0.5~1份、枸杞5~6份、人参5~8份、低聚异麦芽糖1份、玛卡0.5~2份、肉苁蓉0.5~2份。鉴于上述技术方案，本申请能够实现适当饮酒的时候，对饮酒者的身体机能进行恢复，提高身体机能。
一种白酒蒸馏冷凝器，包括有第一冷凝箱和连通于第一冷凝箱下部的第二冷却箱，所述第一冷凝箱内部设置有竖向冷凝管，所述第二冷却箱内设置有回形冷却管，所述第一冷凝箱内设置有上隔板和下隔板，所述竖向冷凝管呈贯穿上隔板和下隔板设置；所述第二冷却箱内设置有阻隔板，所述阻隔版的上边为自由端，所述阻隔版的其他边固定于第二冷却箱的内壁上，该白酒蒸馏冷凝器冷却效果好、节省水资源和热能。