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玉米大斑病菌MAPK基因StIME2的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析

来源:酒旗网  作者:酒小旗   2023-07-03 阅读:820
【目的】确定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)MAPK基因StIME2在基因组中的位置;系统解析目的蛋白质StIme2的结构特征;分析玉米大斑病菌StIME2在不同发育时期及不同胁迫条件下(温度、氧胁迫、高渗胁迫)的表达,为深入研究该基因的功能奠定基础。【方法】通过本地Blast搜索玉米大斑病菌基因组数据库,确定StIME2在基因组的精确位置;利用ProtParam在线分析StIme2蛋白的理化性质,利用SOMPA在线软件预测StIme2蛋白的二级结构。通过PHYRE2在线服务器对StIme2蛋白的三维结构进行预测。利用半定量RT-PCR方法分析不同发育时期及不同胁迫条件下StIME2的表达。【结果】玉米大斑病菌StIME2为一类与酿酒酵母中ScIME2具有较高同源性的基因,为在植物病原真菌中鲜有报道的MAPK基因。该基因的ID为98105,位于scaffold_7正链的1560184—1562574位置,StIme2蛋白具有MAPK类蛋白激酶的特征性保守结构域,其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,β-折叠较少且主要存在于N端,其三级结构具有1个较小的N端域和1个较大的C端域;该基因在病菌分生孢子时期表达量最高,附着胞发育时期表达量最低。将病菌置于不同温度条件下处理,发现培养温度为28℃时StIME2表达量达到最高。在高渗胁迫条件下,随NaCl浓度的增加,StIME2的表达量逐渐增加,但在较高胁迫条件下(0.8 mol·L-1 NaCl),该基因表达几乎被完全抑制。经H2O2胁迫处理后,StIME2的表达量随H2O2的浓度增加而增强,在10 mmol·L-1 H2O2的处理下表达量最高。【结论】玉米大斑病菌StIME2位于scaffold_7正链的1560184—1562574位置。StIme2蛋白具有MAPK激酶的所有特征性保守结构域,为一类功能鲜有报道的MAPK蛋白激酶。该基因在玉米大斑病菌分生孢子时期表达量最高,推测可能在调控病菌分生孢子发育过程中起重要作用。该基因的表达水平可随培养温度的变化而变化,28℃表达量最高。该基因可能参与病菌的高渗胁迫及氧胁迫反应。
本发明属于食品加工领域,尤其涉及一种白酒籼米散曲的制备方法,应用于小曲白酒生产领域,在白酒酿造过程中主要起糖化、发酵作用,其特征在于:包括以下步骤:淘洗、浸泡、分装三角瓶、蒸米、冷却、接种、恒温培养和摇瓶、贮存:当米粒表面张满菌丝,米粒微微泛黄时即成,保存。本发明具有操作简单、使用方便、酶活力高、劳动强度低、易实现机械化生产等优势。
以麦芽汁为发酵培养基,对7.5L自动发酵罐中酿酒酵母Y518分批发酵生产谷胱甘肽的实验数据进行分析,建立谷胱甘肽分批发酵动力学模型.通过对符合菌体生长的Logistic方程、产物生成的Luedeking-Piret方程和基质消耗的物料衡算方程进行最优参数估计和非线性拟合,分别得到了相应的动力学模型和最佳模型参数值.对动力学模型的拟合曲线进行分析,发现模型的计算值与实验值能较好地拟合,表明本实验建立的分批发酵动力学模型能较好地反映谷胱甘肽分批发酵过程.
目的 比较两种不同的NIH 小鼠种群基因组DNA中H-2q单倍型的百分比,对重组基因乙型肝炎疫苗 (酿酒酵母)、重组基因乙型肝炎疫苗 (CHO)、重组基因乙型肝炎疫苗 (汉逊酵母) 和治疗性乙型肝炎疫苗 (乙克) 免疫应答的影响.方法检测乙肝疫苗免疫效力用酶标法,测定乙肝疫苗的ED50值,再通过微量细胞毒法和PCR方法检测小鼠的H-2单倍型,计算不同品系小鼠H-2q的百分数,得出乙肝疫苗与不同动物种群的相关性.结果经验证,经1号NIH小鼠检测结果证实,重组基因乙型肝炎免疫效力依次为CHO>汉逊>酿酒,疗性乙型肝炎疫苗 (乙克) 效力检测合格,但经2号NIH 小鼠检测结果显示除CHO疫苗合格外,其他三种疫苗检测结果均为不合格.基因检测结果为,1号种群NIH鼠含有H-2q型基因的百分比是96%,而2号种群NIH 小鼠含有H-2q型基因基因百分比为30%,因此不同的q型基因百分比导致了不同的检测结果. 结论根据本研究结果表明虽然NIH鼠的H-2单倍型中有q型基因,但不同来源的小鼠种群之间会存在差异,经不同的环境饲养后,小鼠的基因会发生不同的变化,因此在进行生物制品检定时,要注意不同品系小鼠及同一品系小鼠不同种群之间的差异对试验本身的影响.建立一种"动物免疫"的概念.
L 阿拉伯糖是木质纤维素原料中一种重要的五碳糖组分,但传统的乙醇生产菌株酿酒酵母( Saccharomyces cerevisiae)不能利用L 阿拉伯糖。通过代谢途径工程手段,在酿酒酵母中引入L 阿拉伯糖初始代谢途径可以获得能利用L 阿拉伯糖乙醇发酵的重组菌株。并且,通过代谢途径的疏通以及吸收系统的优化可以强化重组菌株代谢L 阿拉伯糖的能力。笔者从以上角度综述了近年来酿酒酵母转化L 阿拉伯糖生产乙醇的研究进展。
[目的]对1977-2016年粒用高粱生产现状和审定品种的产量及品质相关性状进行分析,以期为高粱品种选育和生产提供参考.[方法]通过查阅行业年鉴和相关文献,统计了国家和省级审定并公开的品种324个,搜集其区试单产、穗粒重、千粒重、生育期、株高、穗长,以及品质相关性状包括淀粉、单宁、蛋白质、赖氨酸与脂肪含量的数据.[结果]从时间演变来看,40年来审定品种数随年份持续增加.株高呈下降趋势,平均每年降低1.36 cm.区试单产呈显著上升趋势,平均每年提高69.1 kg·hm-2;淀粉和单宁含量呈显著上升趋势(P<0.05),蛋白质含量呈显著下降趋势(P<0.05),赖氨酸和脂肪含量则无显著变化.从空间分布来看,生育期的平均值在春播早熟区、春播晚熟区、春夏兼播区和南方区的变化范围为94-126 d;春夏兼播区的穗粒重最高(105.4 g),南方区最低(64.6 g);千粒重在春播晚熟区最高(30.3 g),南方区最低(22.6 g),分区间均表现出显著差异(P<0.05);淀粉含量在春播早熟区和春播晚熟区较高,平均为74.2%,而脂肪含量较低,平均为3.5%;单宁在南方区含量最高(1.1%);蛋白质和赖氨酸含量在分区间无显著性差异.[结论]建议今后品种选育把植株矮化和提高千粒重作为提高产量的重点策略,品质上向专用型发展.酿酒高粱应保证适当高淀粉含量、合理的蛋白质和脂肪含量范围,注重提高单宁含量.而饲料高粱应保证高淀粉,注重降低单宁并提高蛋白质、赖氨酸含量.

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